L'ARPA Lazio svolge, nel campo della vigilanza e del controllo, un ruolo di supporto tecnico alle aziende sanitarie locali (ASL) titolari delle funzioni di controllo in materia di prodotti alimentari, acque ad uso umano (acqua destinata al consumo umano, acque minerali e termali, acque di piscina, acque di dialisi) e cosmetici.

I laboratori dell'Agenzia svolgono, inoltre, attività di controllo e accertamento attraverso sopralluoghi, ispezioni, campionamenti ed analisi, intervenendo con funzioni di supporto tecnico-analitico nel controllo effettuato dai dipartimenti di prevenzione delle ASL a seguito di notifica di uno o più casi di legionellosi e, su richiesta di un privato, a sostegno dell'attività preventiva di monitoraggio di strutture ricettive, sia pubbliche che private.